我們所知道的所有生命都使用完全相同的能量攜帶分子作為一種「通用細胞燃料」。 現在,一項新的研究報告說,古代化學可以解釋這個最重要的分子是如何成為 ATP(三磷酸腺苷)的。
ATP 是一種有機分子,通過光合作用或細胞呼吸(生物體分解食物的方式)充電並用於每個細胞。每天,我們都會在 ATP 中回收我們自己的體重。
在上述兩個系統中,磷酸分子通過稱為磷酸化的反應添加到 ADP(二磷酸腺苷)中-產生 ATP。
釋放相同磷酸鹽的反應(在另一個稱為水解的過程中)提供化學能量,我們的細胞在無數過程使用這些能量,從大腦信號傳導到運動和繁殖。
ATP 如何取代許多可能的等價物而成為代謝的主導,一直是生物學中的一個長期謎團,也是研究的重點。
倫敦大學學院進化生化學家尼克萊恩解釋說:「我們的研究結果表明— ATP 作為細胞的通用能量貨幣的出現並不是‘凍結事故’的結果,而是磷酸化分子獨特相互作用引起的。 」
所有生物都使用 ATP 的事實表明,它從生命一開始就存在,甚至更早,在我們所有有生命的物質之前的益生元(prebiotic)條件下也是如此。
但研究人員不解的是,當 ATP 具有如此復雜的結構、涉及六種不同的磷酸化反應以及從零開始創造它的大量能量時,怎麼會出現這種情況。
當時在倫敦大學學院工作的生物化學家 Silvana Pinna 和他的同事在論文中說:「ATP 中的‘高能’[磷] 鍵並沒有什麼特別之處。」
但他們指出,由於 ATP 還有助於構建我們細胞的遺傳信息,它可能已通過這條其他途徑被用於能量使用。
Pinna 和團隊懷疑某些其他分子最初一定參與了複雜的磷酸化過程。因此,他們仔細研究了另一種磷酸化分子 AcP,它仍然被細菌和古細菌用於化學物質的新陳代謝,包括磷酸鹽和硫酯——一種被認為在生命開始時就已經很豐富的化學物質。
在鐵離子 (Fe3+)的 存在下,AcP 可以將水中的 ADP 磷酸化為 ATP。在測試其他離子和礦物質在水中催化 ATP 形成的能力後,研究人員無法用其他替代金屬或磷酸化分子複製這一點。
Pinna 說:「發現該反應在金屬離子、磷酸鹽供體和底物中具有選擇性,這令人非常震驚,因為生命仍然在使用的分子。」
在溫和、與生命相容的條件下,這種情況在水中發生得最好,這一事實對於生命的起源來說確實非常重要。
這表明,使用 AcP,這些能量儲存反應可以在生物生命之前的條件下發生,在生物生命在那裡囤積和刺激現在自我延續的 ATP 生產循環之前。
此外研究小組解釋說實驗表明,益生元 ATP 的產生最有可能發生在淡水中,例如,光化學反應和火山爆發可以提供正確的成分組合。
他們指出,雖然這並不能完全排除它在海洋中的出現,但它確實暗示生命的誕生可能需要與陸地有很強的聯繫。
Pinna 及其同事寫道:「我們的研究結果表明,由於 ATP 在水中不同尋常的化學性質,ATP 已成為益生元單體世界中的通用能源貨幣。」
更重要的是,熱液系統中的 pH 值梯度可能導致 ATP 與 ADP 的比例不均勻,即使在小分子的益生元世界中,ATP 也能驅動工作。
Lane 解釋說「隨著時間的推移,合適的催化劑出現,ATP 最終可能取代 AcP 作為普遍存在的磷酸鹽供體,並促進氨基酸和核苷酸聚合形成 RNA、DNA 和蛋白質。」。
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參考資料:
- Koumoundouros,T., (2022,Oct 6). Every Life Form on Earth Uses The Same Chemical For Energy. This Could Explain Why. ScienceAlert
- Pinna S, Kunz C, Halpern A, Harrison SA, Jordan SF, et al. (2022) A prebiotic basis for ATP as the universal energy currency. PLOS Biology 20(10): e3001437. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001437
- 圖片來源:https://www.sciencealert.com/every-life-form-on-earth-uses-the-same-chemical-for-energy-this-could-explain-why(圖:Callista Images/Image Source/Getty Images)